學(xué)校創(chuàng)辦于1934年，時(shí)名湖南國(guó)醫(yī)專科學(xué)校，1960年改辦為普通高等本科院校湖南中醫(yī)學(xué)院，1990年原湖南科技大學(xué)成建制并入湖南中醫(yī)學(xué)院，2002年湖南省中醫(yī)藥研究院與湖南中醫(yī)學(xué)院合并，2006年經(jīng)教育部批準(zhǔn)更名為湖南中醫(yī)藥大學(xué)。2012年學(xué)校進(jìn)入一本招生序列。目前學(xué)校與湖南省中醫(yī)藥研究院實(shí)行校院合一的管理體制。